1、規(guī)模較小，實力偏弱，功能不全。大多數(shù)第三方物流企業(yè)條塊分割嚴重，企業(yè)缺乏整合，集約化經(jīng)營勢不明顯，規(guī)模效益難以實現(xiàn)，只能提供單項或分段的物流服務(wù)。物流功能主要停留在儲存、運輸和城市配送上，相關(guān)的包裝、加工、配貨等增值服務(wù)不多，不能形成完整的物流供應(yīng)鏈。

2、渠道不暢。方面，經(jīng)營網(wǎng)絡(luò)不合理，第三方物流企業(yè)之間、企業(yè)與客戶之間缺乏合作。另方面，信息技術(shù)落后，因特網(wǎng)、條形碼、EDI等信息技術(shù)未能廣泛應(yīng)用，物流企業(yè)和客戶不能充分共享信息資源，沒有結(jié)成相互依賴的伙伴關(guān)系。
3、人才缺乏，設(shè)施落后，管理水平低。第三方物流企業(yè)人才缺乏，素質(zhì)不高。物流設(shè)備落后、老化，機械化程度不高，無法滿足客戶特定要求。
4、制度不健全。第三方物流市場秩序還不規(guī)范，行業(yè)道德低下，人們的公平競爭、公平交易意識淡薄。另外企業(yè)融資制度、產(chǎn)權(quán)制度、產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)讓制度、市場準入退出制度、社會保障制度等不能適應(yīng)企業(yè)經(jīng)營的要求，因而限制了第三方物流快速及時的響應(yīng)。